Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms