Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrm1Q99J25 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrm1Q99J25 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrm1Q99J25 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrm1Q99J25 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrm1Q99J25 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrm1Q99J25 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrm1Q99J25 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrm1Q99J25 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms