Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms