Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms