Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms