Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms