Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcdhga12Q91XY7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms