Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx15Q91WE1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms