Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms