Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms