Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mark1Q8VHJ5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms