Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms