Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenomQ8VHC3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms