Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms