Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Smg8Q8VE18 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Smg8Q8VE18 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Smg8Q8VE18 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Smg8Q8VE18 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Smg8Q8VE18 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Smg8Q8VE18 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Smg8Q8VE18 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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