Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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