Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nae1Q8VBW6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms