Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms