Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms