Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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