Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms