Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Casc3Q8K3W3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Casc3Q8K3W3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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