Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms