Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms