Protein–RNA interactions for Protein: Q8K349

Gimap6, GTPase IMAP family member 6, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimap6Q8K349 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gimap6Q8K349 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Gimap6Q8K349 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gimap6Q8K349 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms