Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms