Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2Q8K2Y9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms