Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms