Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms