Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2D3

Edc3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc3Q8K2D3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edc3Q8K2D3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edc3Q8K2D3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms