Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gtf3c1Q8K284 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c1Q8K284 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c1Q8K284 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c1Q8K284 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c1Q8K284 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gtf3c1Q8K284 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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