Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms