Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms