Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms