Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms