Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctxn1Q8K129 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms