Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms