Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms