Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps50Q8CI71 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms