Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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