Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms