Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc43a2Q8CGA3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms