Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hpf1Q8CFE2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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