Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28bQ8CEG5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms