Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc38Q8CDN8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms