Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms