Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E4f1Q8CCE9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E4f1Q8CCE9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms