Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynpoQ8CC35 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms