Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms