Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms